Niejednokrotnie zdarza się, że komputer zostaje zarażony wirusem, który uruchamia się przy starcie systemu operacyjnego, który wyświetla np. niechciane reklamy, uruchamia szkodliwe programy, uruchamia programy szpiegujące nasze poczynania w sieci (tzw. Spyware ), itp. Wirusy te skonstruowane są tak, by nie dało się ich łatwo deaktywować lub pozbyć z systemu operacyjnego. W tym przypadku pomocne jest zainstalowanie i uruchomienie programu Start-UP , który pokaże nam listę wszystkich programów uruchamianych przy starcie systemu.